Cette plante annuelle des champs peut être confondue avec d’autres espèces de la famille des Lamiaceae comme l’épiaire des champs (Stachys arvensis). Mais contrairement à cette dernière qui pousse en sol acide, l’épiaire annuelle aime les terres calcaires. Tout comme un bon nombre d’autres espèces messicoles, l’épiaire annuelle est directement menacée par les modalités de cultures intensives. On pourrait la confondre avec d’autres plantes comme le Galéopsis des moissons (Galeopsis segetum.